Ciljna područja sustavnog otklanjanja uzroka korupcije su sljedeća:
- poboljšanje usluga javnog sektora s naglaskom na jačanje odgovornosti za uspješno ostvarenje zadaća i promicanje izgradnje integriteta i transparentnosti;
- obavljanje poslovanja na pravilan, etičan, ekonomičan, učinkovit i djelotvoran način;
- usklađivanje poslovanja sa zakonima, propisima, politikama, planovima i postupcima;
- zaštita imovine i drugih resursa od gubitka uzrokovanih lošim upravljanjem, neopravdanim trošenjem i korištenjem te od nepravilnosti i prijevara i pravodobno financijsko izvješćivanje i praćenje rezultata poslovanja.
Izvješća o tijeku provedbe akcijskoga plana za provođenje antikorupcijskoga Programa (mjerama, ciljevima i aktivnostima koje je Financijska agencija poduzela s ciljem povećanja transparentnosti poslovanja te smanjenja rizika od nepravilnosti, prijevara i korupcije) dostavljaju se Ministarstvu financija kvartalno, a najkasnije 30 dana nakon završetka kvartala.